Noe metan kan ha blitt produsert ved uorganiske prosesser. Den opprinnelige kilden til jordens karbon var det kosmiske rusk som planeten ble dannet fra. Hvis meteoritter er representative for dette rusk, kan karbonet ha blitt tilført i relativt høye konsentrasjoner som hydrokarboner, slik som finnes i den karbonholdige kondritttypen av meteoritter. Kontinuerlig utgassing av disse hydrokarbonene kan finne sted fra jordens indre, og noen kan ha akkumulert som abiogene gassforekomster uten å ha gått gjennom en organisk fase. Ved utbredt utgassing er det imidlertid sannsynlig at abiogen gass vil være for diffus til å være av kommersiell interesse. Betydelige ansamlinger av uorganisk metan er ennå ikke funnet.
Heliumet og noe av argonet som finnes i naturgass er produkter av naturlig radioaktiv desintegrasjon. Helium stammer fra radioisotoper av thorium og uranfamilien, og argon stammer fra kalium. Det er sannsynligvis tilfeldig at helium og argon noen ganger forekommer med naturgass; med all sannsynlighet ble de urelaterte gassene ganske enkelt fanget i samme felle.
